Prilagođena sinteza peptida ima širok raspon primjena u raznim područjima, uključujući:
1. Biokemijska i biološka istraživanja: Sintetski peptidi mogu poslužiti kao važan alat u biokemijskim i biološkim eksperimentima za proučavanje funkcije proteina, stanične signalizacije i više.
2. Farmakologija i molekularna medicina: Prilagođeni peptidi mogu se koristiti za razvoj lijekova, kao potencijalni kandidati za lijekove ili za pripremu modela bolesti.
3. Biotehnologija: U biotehnološkoj industriji prilagođeni peptidi se obično koriste za visokoučinkoviti probir, pripremu medija za kulturu stanica i razvoj reagensa za biološke analize.