Fluorescentni peptid

 

Fluorescentni i -obilježeni peptidi razvijeni su za in vivo biomedicinsko oslikavanje, vezanje proteina, studije lokalizacije i više. Fluorescentne boje mogu se pričvrstiti izravno na N-kraj peptida (npr. FITC, često s aminoheksanskom kiselinom (Ahx) ili -Ala poveznicom umetnutom između fluorofora (fluorescein) i N-kraja peptida), na Lys ili Cys bočne lance na C-kraju ili na različitim druge pozicije unutar peptida.

 

Biorunstar pruža mnoge često korištene fluorescentne i -označene peptide, kao što su FITC, FAM, TAMRA, NBD (7-nitrobenz-2-oksa-1,3-diazol), Amc, Atto, Alexa Fluor, Bodipy, Cy3, Cy5 i još mnogo toga.Svaki fluorescentni ili bojom-označeni peptid isporučuje se kao liofilizirani prah u folijom-prekrivenoj tubi.

 

FITC

Fluorescein izotiocijanat (FITC), aminski -reaktivni derivat fluoresceinske boje, intenzivno se koristi za označavanje peptida i proteina.Može se označiti na N-kraju peptida ili na bočnom lancu lizina.

Fluorescein ili boja	Boja	Maksimalna apsorpcija	Maksimalna emisija
FITC	zelena	495 nm	521 nm

 

FAM

FAM je fluorescentna boja koja se često koristi u konfokalnoj laserskoj -skenirajućoj mikroskopiji i aplikacijama protočne citometrije.

 

Rodamin B

Rodamin B predstavlja jednu u nizu rodaminskih boja koje se koriste u ispitivanjima fluorescencije.

Fluorescein ili boja	Boja	Maksimalna apsorpcija	Maksimalna emisija
Rodamin B	Narančasto	550 nm	580 nm

 

TAMRA

TAMRA je jedan od najpopularnijih narančastih fluorofora koji se koristi za označavanje peptida i proteina.

Fluorescein ili boja	Boja	Maksimalna apsorpcija	Maksimalna emisija
Rodamin B	Narančasto	544 nm	576 nm

 

NBD (7-nitrobenz-2-oksa-1,3-diazol)

NBD-označeni peptidi prijavljeni su kao popularan izbor u biološkim studijama membrana i stanica.

Fluorescein ili boja	Boja	Maksimalna apsorpcija	Maksimalna emisija
NBD	narančasta	486 nm	543 nm

 

AMC

AMC (7-amino-4-metilkumarinil), UV-pobuđujuća boja, koristi se u enzimskim testovima pomoću kiveta ili protočne citometrije.

Fluorescein ili boja	Boja	Maksimalna apsorpcija	Maksimalna emisija
AMC	plava	353 nm	422 nm

 

Cy3 i Cy5

Cy3 i Cy5 su boje s iznimno visokim koeficijentima ekstinkcije i fluorescencije, što ih čini posebno prikladnima za vrlo osjetljive testove lokalizacije peptida u stanicama. Međutim, njihov glavni nedostatak je visoka nestabilnost ovih molekula u uvjetima sinteze peptida, što dovodi do relativno niskih prinosa.