Usporedba kemijskih svojstava PNA i DNA
PNA (peptidna nukleinska kiselina) i DNA (dezoksiribonukleinska kiselina) imaju značajne razlike u kemijskim svojstvima, što se uglavnom ogleda u njihovoj molekularnoj strukturi, sastavnim jedinicama, bazama i prostornoj strukturi.
Molekularna struktura i sastavne jedinice
Molekularni kostur DNA povezan je izmjeničnim deoksiriboznim i fosfatnim vezama preko fosfodiesterskih veza. Glavni lanac PNA sastoji se od ponovljenih jedinica N-(2-aminoetil)-glicina povezanih peptidnim vezama (amidne veze). To znači da glavni lanac PNA ne sadrži negativno nabijene fosfodiesterske skupine, što čini vezanje između PNA i DNA lanaca jačim nego između DNA lanaca.
Osnovni sastav
Baze DNK su adenin (A), timin (T), citozin (C) i gvanin (G). Nasuprot tome, baza PNA spaja se s N glicinskog dijela u glavnom lancu kroz acetilnu strukturu. Iako se bazne sekvence PNA mogu vezati na DNA lance, njihovi načini vezanja i stabilnost su različiti. Baze bočnih lanaca PNA mogu tvoriti vodikove veze s bazama glavnog žlijeba dvolančane spirale dvolančane RNA ili DNA, čime se vežu za vanjsku stranu dvolančane RNA ili DNA.
Prostorna struktura i funkcija
DNK obično postoji u strukturi dvostruke spirale, koja je ključna za održavanje stabilnosti i prijenos genetskih informacija. PNA može formirati strukturu trostruke spirale, koja ima jedinstvene prednosti u određenim primjenama kao što je uređivanje gena i senzor nukleinskih kiselina.
Kombiniranje značajki i aplikacija
Zbog nepostojanja negativno nabijenih fosfodiesterskih skupina u glavnom lancu PNA, može se specifično vezati na DNA i RNA pri niskim koncentracijama soli. Ova karakteristika čini PNA stabilnijim i specifičnijim kada se koristi kao sonda ili sustav za isporuku lijeka. Metabolička stabilnost i snažan afinitet vezanja PNA čine ga korisnim alatom za antigensku terapiju, koja može inhibirati spajanje ili translaciju ciljne mRNA.
Sažetak
Sve u svemu, glavne razlike u kemijskim svojstvima između PNA i DNA leže u njihovoj molekularnoj strukturi, sastavnim jedinicama, bazama i prostornoj strukturi. Ove razlike daju PNA jedinstvene prednosti u određenim primjenama, posebice u područjima kao što su uređivanje gena i senzor nukleinskih kiselina.
